Az Európai Tanács Erasmus Mundus 2009-2013 programán keresztül, előrelátta az egyesített doktori képzések támogatását is, a már meglévő mester képzések mellett. A következő évtől 13 doktori képzést indítanak útjára, melyből a legtöbb a mérnöki és technológiai diszciplinákat öleli fel. Bár ez mellet találhatunk a társadalomtudományok, a jog, az egészségügy, és a természettudományok terén is számunka megfelelő képzéseket. A doktori képzésekkel járó ösztöndíjak három évre szólnak és havi 2000-től 3000 euróig terjednek programtól függően. Ezek mellett, a doktori hallgatók jogosultak útiköltség megtérítésre, valamint külön támogatást kapnak konferenciákon való részvételre. Habár ki kell emelni azt is, hogy mindegyik Erasmus Mundus doktori képzés tandíjas, aminek a pontos összegét a programot szervező konzorcium határozza meg.